ओपन-सोर्स एन्क्रिप्शन सॉफ्टवेयर के खिलाफ दिया जाने वाला एक तर्क यह है कि यह प्रोप्राइटरी सॉफ्टवेयर की तुलना में कम सुरक्षित है क्योंकि इसमें कोई भी योगदान दे सकता है। हालाँकि, ऐसा नहीं है।

लागत कम होने और लचीलापन बढ़ने के अलावा, ओपन-सोर्स परियोजनाएं कमजोरियों के बारे में अधिक पारदर्शी होती हैं क्योंकि सोर्स कोड सार्वजनिक रूप से सुलभ होता है। इसके खुले स्वभाव के कारण, समुदाय का कोई भी व्यक्ति व्यापक समुदाय के लिए गंभीर खतरा बनने से पहले ही सुरक्षा खामियों का पता लगा सकता है और उन्हें हल कर सकता है।  

यदि आप एक डेवलपर हैं, तो आप स्वयं कोड की समीक्षा कर सकते हैं, संशोधन कर सकते हैं और सॉफ्टवेयर का कस्टम संस्करण भी जारी कर सकते हैं। ओपन-सोर्स प्रोजेक्ट तकनीकी विशेषज्ञता वाले किसी भी व्यक्ति को टूटे हुए कोड को ठीक करने की अनुमति देते हैं, जबकि प्रोप्राइटरी सॉफ्टवेयर के साथ, केवल वेंडर या कंपनी ही इसकी जांच और अपडेट कर सकती है। परिणामस्वरूप, ओपन-सोर्स सॉफ्टवेयर अक्सर प्रोप्राइटरी सॉफ्टवेयर की तुलना में अधिक विश्वसनीय और सुरक्षित होता है।

यद्यपि ओपन-सोर्स सॉफ्टवेयर किसी के भी द्वारा संशोधन के लिए उपलब्ध है, इसका मतलब यह नहीं है कि हर संशोधन को स्वीकार कर लिया जाता है, जिससे कम गुणवत्ता वाला टूल बन सकता है। वास्तव में, अधिकांश ओपन-सोर्स प्रोजेक्ट एक वर्कफ़्लो का उपयोग करते हैं जहां एक प्रमुख डेवलपर या डेवलपर्स के समूह को कोड में किए गए सभी परिवर्तनों को मंजूरी देनी होती है। कई ओपन-सोर्स प्रोजेक्ट प्रोप्राइटरी प्रोजेक्ट्स के समान ही गुणवत्ता आश्वासन जांच से गुजरते हैं, क्योंकि वे कोड समीक्षा और परीक्षण से गुजरते हैं तथा सुसंगत दिशानिर्देशों का पालन करते हैं(नई विंडो)। 

ओपन-सोर्स प्रोजेक्ट्स डेवलपर्स और स्वयंसेवकों के जीवंत समुदायों से घिरे होते हैं, जिनकी उच्च गुणवत्ता वाले उत्पाद बनाने में सामूहिक रुचि होती है। कम्युनिटी जितनी बड़ी होगी, आपके सामने आ रही समस्या का समाधान मिलने की संभावना उतनी ही अधिक होगी। अधिकांश ओपन-सोर्स प्रोजेक्ट्स में समर्पित फ़ोरम होते हैं जहाँ उपयोगकर्ता प्रश्न पोस्ट कर सकते हैं और क्राउडसोर्सिंग के माध्यम से बग्स का निवारण कर सकते हैं।

जब कोई प्रोजेक्ट ओपन सोर्स होता है, तो आप बग को हल करने और अपडेट प्राप्त करने के लिए आवश्यक समय का अंदाज़ा लगाने हेतु संस्करण इतिहास को भी देख सकते हैं। इसके अतिरिक्त, कई तकनीकी कंपनियां अपनी परियोजनाओं में ओपन-सोर्स कोड का उपयोग करती हैं, जो बड़े ओपन-सोर्स उपक्रमों के निरंतर समर्थन के लिए एक मजबूत विश्वास मत है। 

सोर्स कोड को खोलकर, कोई भी सीधे सत्यापित कर सकता है कि एन्क्रिप्शन सुविधाएं सही ढंग से लागू की गई हैं और इसमें कोई बैकडोर नहीं बनाया गया है। आप स्वतंत्र ऑडिट आयोजित करने के लिए तीसरें-पार्टी सुरक्षा फर्मों को भी नियुक्त कर सकते हैं।  

ओपन-सोर्स एन्क्रिप्शन व्यक्तियों, अनुभवी डेवलपर्स और क्रिप्टोग्राफी विशेषज्ञों को यह जानने में सक्षम बनाता है कि कौन से एल्गोरिदम नियोजित हैं, वे कैसे काम करते हैं, और संभावित खामियों और कमजोरियों को इंगित करते हैं। यह पारदर्शिता बग्स को जल्दी से हल करना और किसी एप्लिकेशन की सुरक्षा का स्वतंत्र रूप से आकलन करना संभव बनाती है, जिससे बेहतर निजता प्राप्त होती है।